Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms