Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CDK5R2Q13319 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CDK5R2Q13319 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CDK5R2Q13319 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CDK5R2Q13319 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CDK5R2Q13319 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R2Q13319 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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CDK5R2Q13319 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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CDK5R2Q13319 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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