Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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SCGB2A2Q13296 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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SCGB2A2Q13296 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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SCGB2A2Q13296 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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SCGB2A2Q13296 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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SCGB2A2Q13296 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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