Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.6 ms