Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TROQ12816 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TROQ12816 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TROQ12816 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TROQ12816 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
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