Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms