Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms