Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN2Q02246 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms