Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms