Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRX1P78414 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRX1P78414 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRX1P78414 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRX1P78414 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRX1P78414 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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