Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms