Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms