Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ACTBP60709 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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