Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms