Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms