Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNB3P54284 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB3P54284 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms