Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOSBP53539 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOSBP53539 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOSBP53539 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOSBP53539 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOSBP53539 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOSBP53539 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms