Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPC3P51654 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPC3P51654 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPC3P51654 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPC3P51654 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPC3P51654 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPC3P51654 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPC3P51654 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms