Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF6P49848 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms