Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP4P49662 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms