Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms