Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms