Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5C1P36542 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms