Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HOXD12P35452 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HOXD12P35452 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HOXD12P35452 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HOXD12P35452 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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HOXD12P35452 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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HOXD12P35452 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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HOXD12P35452 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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