Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPREP23469 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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