Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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