Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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CXCL3P19876 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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CXCL3P19876 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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CXCL3P19876 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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CXCL3P19876 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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CXCL3P19876 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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