Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPD1P17405 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms