Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GP1BBP13224 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms