Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms