Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SETSIPP0DME0 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms