Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNB1P01574 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms