Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ZNF208O43345 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ZNF208O43345 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ZNF208O43345 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ZNF208O43345 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ZNF208O43345 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ZNF208O43345 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ZNF208O43345 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ZNF208O43345 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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