Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA6L4A6NEF3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms