Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
XIRP2A4UGR9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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