Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCHNA4D1U4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms