Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms