Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms