Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRFN1Q9P244 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LRFN1Q9P244 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LRFN1Q9P244 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LRFN1Q9P244 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRFN1Q9P244 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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