Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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SH3BP4Q9P0V3 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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SH3BP4Q9P0V3 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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SH3BP4Q9P0V3 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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