Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms