Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms