Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms