Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms