Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPIN3Q9BQK8 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms