Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3CQ99985 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms