Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms