Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms