Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAMP1Q96JM3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms