Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BORCS6Q96GS4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms